Affonso Augusto Moreira Penna nasceu em 30 de novembro de 1847. Em 1870, formou-se em Direito pela Faculdade de São Paulo, vindo a ocupar o cargo de Conselheiro do Estado. Foi ministro por diversas vezes e Vice-Presidente da República no quadriênio de Rodrigues Alves. Em seguida, elegeu-se Presidente, pelo período de novembro de 1906 a junho de 1909. Na sua gestão reorganizou a esquadra brasileira, instituiu o serviço militar obrigatório, organizou o serviço de imigração e de fornecimento agrícola, expandiu a viação férrea para o interior, criou a Caixa de Conversão e o Instituto de Manguinhos. Faleceu em 14 de julho de 1909.

A Escola Affonso Penna, primeiramente, estava localizada na Rua Camerino, no centro da cidade. Inaugurada em 20 de janeiro de 1908, na gestão do Prefeito Francisco Marcelino de Souza Aguiar, foi transferida, em 1928, para a Rua Barão de Mesquita. Em 1936, foi interditada para obras, que finalizaram em 1937. Foi reinaugurada em 30 de novembro de 1937, na gestão do Prefeito Henrique Dodsworth e do Secretário de Educação Francisco Campos.