A Escola Anne Frank foi inaugurada pelo Governador do Estado da Guanabara Carlos Lacerda (1960/1965).

O prédio, onde funciona a escola, de propriedade do Palácio da Guanabara, era a Casa da Guarda do Palácio.

O nome da escola homenageia Anne Frank, adolescente alemã, de origem judaica, vitimada pelo holocausto nazista, em 1945, dois meses antes de terminar a 2ª Guerra Mundial.